Patient med andningsproblem – virusjakt!
Det är höst 2021. Person X har efter en veckas förkylning plötsligt fått svårt att andas. Är det covid-19? Varifrån kommer smittan? Du har rollen som sjukhusets bioinformatiker och ska hjälpa läkaren. Du får denna epost:
- Kan vi bekräfta att det är SARS-CoV-2 som infekterat? Och isåfall – har viruset några särskilda förändringar i genen för spikeproteinet i den del av viruset som fäster till människans celler via ACE2-receptorn?
- Är viruset av någon av de kända varianterna som är i omlopp? (delta? omikron?)
- Kan vi se om patienten har smittats av kollegan som nyss varit i Italien?
Ditt uppdrag är att hitta så bra svar som möjligt på alla tre frågor och avsluta med att formulera ett mail till läkaren (läraren).
Ta det steg för steg.
Lycka till!